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碳源 其中碳就是污水中的有机物，自然界中也存在很多不能被微生物所降解的有机污染物，在环保领域经常用BOD5和COD的比值来平均污水的可生化性，当BOD5/COD≥0.6评价为易降解有机物。BOD5/COD=0.2~0.4评价为含有难降解有机物，较难被生物处理。BOD5/COD≤0.2评价为有机物可生化性差，难以被微生物所降解。BOD5/COD≤0.2的污水在处理中往往活性污泥存在负增长，不能维持系统持续处理有机物的生物量，此工况下，往往需要额外补充含碳元素并容易被微生物利用的碳源，作为微生物生长代谢细胞合成的能源。
碳源 现代研究认为碳氮比小于10，异养细菌优先利用有机氮，养殖水体氨氮增加，如果碳氮比大于10异养细菌可同时利用有机氮和无机氮，消耗铵态氮。异养细菌数量的增加，有利于形成生物絮团，其中包括细菌，藻类，有机物，原生动物，浮游动物等。在适合的碳氮比及溶解氧情况下，不需要额外添加异养细菌，细菌就会自行繁殖生长，达到控制水体环境的目的。一般认为水产养殖中合适的碳氮比水平在10-15:1，越是使用饲料蛋白高的饲料，水体中也就越缺乏碳源，所以适时适量补充碳源尤为重要。
