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碳源 工业发酵中使用的糖类可分为单糖、双糖、淀粉质类和糖蜜等。葡萄糖是工业发酵常用的单糖，由淀粉加工制备，其产品有固体粉末状葡萄糖、葡萄糖糖浆（含少量双糖）。它们被广泛用于抗生素、氨基酸、有机酸、多糖、笛类转化等发酵生产中。大多数微生物都可以利用葡萄糖作为碳源，木糖和其他单糖由于成本等原因生产中用得很少。工业发酵中使用的燕糖和乳糖既有纯品，也有含此二种糖的糖蜜和乳清。麦芽糖多用其糖浆。主要用于抗生素、氨基酸、有机酸、酶类的发酵。
碳源 平时我们所用的培养基一个重要参数就是碳氮比，细菌的供能物质来自碳源，当氮源高时相对碳源低，细菌没有充足能量合成蛋白质和进行生命活动，生长也就慢了。碳氮比在我们的种植、发酵过程中，是不可忽视的指标。若碳氮比适中，则微生物分解速度快，净化能力就强。结合当前高密度养殖的实际情况不难看出，越是使用高蛋白的饲料，池塘中碳源的缺乏就越加严重，适时适量补充有机碳源就显得更加必要。因为我们投喂的饲料中的蛋白质，能消化吸引的只有20%-25%，剩下的氮要靠我们的有益微生物和藻类吸引。但是有益微生物和藻类转化掉这些东西需要消耗掉大量的碳源，像有益微生物适宜生长繁殖的碳氮比为（20-30):1，藻类则是6：1，两者平衡起来，养殖水体较为理想的碳氮比为15：1。
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